ThinLinc är byggt för att skapa säkra system. Detta sker på flera plan. Kommunikationen mellan arbetsstationen och servern är avlyssningssäkrad och krypterad. Serversystemet är driftsäkert och tillgängligt. Centraliseringen av applikationer medför att säkerhetsuppgraderingar och virusskydd hanteras på en plats, vilket gör dem lättare att överblicka.

Genom att använda en katalogtjänst för att autentisera användargrupper eller enskilda individer kan informationsflödet i och utanför organisationen säkerställas för att minska risker för spill eller läckage. ThinLinc stödjer de flesta förekommande katalogtjänsterna.

Säker kommunikation

ThinLinc använder OpenSSH för att säkra kommunikationen mellan klientdator och server. Istället för att använda IPSEC, som kan vara svårt att ställa in samt kan skapa problem i nätverket, skapar SSH en tunnel kring det vanliga protokollet och krypterar därmed innehållet. I SSH-protokollet finns dessutom inbyggt skydd för avlyssning, vilket gör att attacker av typen "Man-In-The-Middle" blir omöjliga. OpenSSH har stöd för en stor mängd krypteringsalgoritmer, med ända upp till 256 bitars kryptering.

Tillgänglighet

En viktig aspekt av säkerhet handlar om tillgänglighet. ThinLinc kan kopplas samman i olika former av kluster. Det vanligaste exemplet är lastbalansering, där två eller flera maskiner används optimalt. Ett annat exempel är ett högtillgänglighetskluster, där en redundant maskin tar över om huvudservern fallerar, för att på det sättet säkra funktionen.

Sessioner

Tack vare sessionshanteringen i ThinLinc säkerställs även att inget arbete förloras ifall en arbetsstation havererar eller förbindelsen med servern tappas. När användaren loggar in nästa gång finns allt arbete kvar, sparat i sessionen på servern, och det är bara att fortsätta jobba.